医学院、法规遵从办公室和信息技术办公室设计了这个网站,以帮助教职员工搜索科罗拉多大学安舒茨医学院可用的IT计算资源。这个网站将允许您比较每种技术资源,以找到适合您的研究计算需求的最佳工具。
首先在左侧栏中选择一个技术类别(计算、共享、存储、分析、收集/访问和实验室管理),然后选择您想要探索的IT资源。滚动到屏幕底部,查看详细说明和比较所选结果的表格。
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在高性能环境中处理数据。
与科罗拉多大学系统内的同事以及其他大学和实体协作并交换数据。
使用批准的系统在互联网或校园服务器上存储,保护,存档和备份数据。
通过报告、可视化、数字发现和统计分析策略,从数据中获得知识和见解。
收集、组织、标准化、验证、提取、转换和加载数据。
规范、记录和保护研究实验室协议、工作流程和数据。
健康数据罗盘 | 搬运工 | 表 | 所以 | Qualtrics | 加拿大国际发展署 | 的见解 | Isilon上的文件存储 | OneDrive | 实验室档案 | OnCore | 微软Office 365 | Egnyte | CU Anschutz数字收藏 | 尤里卡 | CrashPlan | 高山 | 尾注 | TriNetX | 安全本地计算环境 | PetaLibrary | CRIIU | BBSR | CHBC | |
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描述 | Compass集成了来自科罗拉多大学健康和儿童医院电子医疗记录的患者数据,来自科罗拉多大学医学的提供商账单数据,以及来自科罗拉多个性化医疗中心的组学数据。这些数据通过各种国家和公共数据源得到进一步丰富。Compass使用先进的算法将这些数据链接起来,以创建无法在任何单一数据源中存在的纵向记录。Compass通过一系列方式将这些数据提供给我们的合作伙伴,从自助去识别队列分析到适合高级分析的完全识别的线级数据集。 |
REDCap是一个安全的网络平台,用于构建和管理在线数据库和调查。REDCap快速创建和设计项目的简化流程提供了大量的工具,可以根据几乎任何数据收集策略进行定制。 |
Tableau用于创建可视化,以帮助通过拖放界面理解和探索数据。表is compatible with may data sources including SQL and Oracle databases as well as Excel and text files. Tableau reports can be published to the University's Tableau server for sharing and collaboration with the campus community. |
Formstack是一个非常灵活的在线表单构建和数据收集工具,可以用来完成各种各样的任务。Formstack主要有三个方面:表单生成器:选择不同类型的字段和菜单来设计表单2。表单设置:配置从通知电子邮件到审批工作流和表单安全的所有内容。提交数据库。查看,编辑,导出或操作已通过您的表单提交的数据 |
用户将通过一系列步骤指导使用多个模板之一创建在线调查。Qualtrics以图形和统计的方式显示调查结果,以便进行分析。 |
创新设计与分析中心(CIDA)是CU Anschutz的中心研究设计和分析资源。CIDA还开展了开发新的生物统计学和数据科学方法的初步研究。生物统计学家、数据科学家和健康经济学家组成的多样化团队主要由来自科罗拉多大学安舒茨医学校区科罗拉多公共卫生学院生物统计和信息系的教职员工和研究生学徒组成。不知道从哪里开始,只需提交一个快速咨询的请求,团队成员将帮助您找到适合您需求的正确设计和分析资源。 |
OnCore临床试验数据可视化仪表板 |
标准的文件存储是合规的、安全的、高可用性的、可靠的,并符合与业务连续性实践有关的法规。通过映射驱动器提供接口,方便地与团队存储和共享文件。 |
OneDrive为科罗拉多大学的每个用户提供在线存储。您可以存储,共享,并同步您的工作文件与个人在大学内外。每个用户获得5TB的文件存储空间。 |
研究实验室的数据管理解决方案。有助于审查实验结果和确保机构研究数据的完整性。它可以用来与校园内外的其他研究人员合作。 |
OnCore是一个临床试验管理系统,用于管理方案、受试者、账单和生物标本。科罗拉多大学安舒茨医学校区(CU-Anschutz)、科罗拉多大学卫生系统(UCHealth)和科罗拉多儿童医院(CHCO)使用OnCore作为全校范围的平台来管理临床研究,并促进财政和运营合规。 |
微软Office 365(0365)套件提供Microsoft Office软件产品,包括Outlook、OneDrive、Word、Excel、PowerPoint、OneNote、SharePoint和Microsoft Teams。 |
Egnyte提供在线存储、协作和共享功能,您可以从任何地方访问文件。 |
科罗拉多大学安舒茨数字收藏是科罗拉多大学安舒茨医学校区及其附属机构的机构存储库。CU Anschutz数字收藏由施特劳斯健康科学图书馆的工作人员管理,并由第三方泛在存储库托管。数字馆藏收集、保存并提供访问数字化图书馆馆藏、档案、当前研究和其他学术和创造性作品的途径。 |
Eureka是由Health Data Compass设计和管理的基于云的分析平台,用于为数据科学家和开发人员快速提供基于云的、符合hipaa标准的虚拟机。这项服务使我们的合作伙伴能够访问高性能的计算环境,以满足各种高级分析需求,从统计和可视化到生物信息处理、深度学习等等。Eureka建立在谷歌云平台上。 |
Crashplan是一个安全的工具,用于持续备份您的笔记本电脑或台式电脑。你可以在任何时候通过网络浏览器或直接从你的电脑上访问你的数据。 |
安舒茨医学校区与我们在博尔德的姐妹校区合作,为研究人员提供高性能计算资源。Alpine是科罗拉多大学博尔德研究计算中心的第三代高性能计算(HPC)集群。Alpine是一个异构计算集群,目前由科罗拉多大学博尔德分校、科罗拉多州立大学和安舒茨医学院提供的硬件组成。Alpine目前提供317个计算节点和总共18080个核心。集群中有CPU节点、GPU节点和高内存节点。使用OpenOnDemand或ssh连接到CURC系统,可以随时随地安全地访问Alpine。 |
EndNote是一个引用管理软件,它将引用和引用相关的材料(如文章的pdf)组织在一个可搜索的个人库中。 |
Health Data Compass能够通过TriNetX网站以完全去识别的聚合形式访问uchealhealth患者数据。TriNetX允许用户从uchealhealth的Epic医疗记录系统收集的一系列标准中识别纳入和排除标准,包括时间关系。然后,用户可以探索由各种人口特征分层的结果队列。 |
SLCE服务包括运行在安舒茨医疗园区菲茨西蒙斯数据中心服务器硬件上的高性能Windows 10或Linux系统。服务器硬件可以根据研究人员的计算需求进行定制,包括中央处理器(CPU)的类型、随机访问内存(RAM)的数量和磁盘配置(类型、速度、冗余和总存储)。此外,SLCE中的系统设计为容错,并配置了冗余硬件,包括双网卡和电源。 |
作为一项新的综合数据管理计划的一部分,安舒茨医学校区与科罗拉多大学博尔德分校的研究计算合作,为存储研究数据提供了一种新的服务。这项服务被称为PetaLibrary——一种用于存档不经常访问的研究数据的企业存储产品。其目标是为数据存储创造效率,并降低与存储大量研究数据相关的成本。这项服务得到了美国国家科学基金会的资助,并得到了博尔德校区50多名研究人员的机构支持。目前大约有1.2PB的研究数据存档在该服务中。PetaLibrary还可以用于与其他机构的同事共享大型数据集,并传输数据,这些数据将用于在博尔德的Research Computing提供的Summit高性能集群上进行分析。 |
临床研究信息学和创新部门(CRIIU)支持研究人员发起的研究或创新,这些研究或创新需要与Epic和其他非Epic临床信息学创新进行整合和修改,以增加Anschutz和UCHealth研究人员的外部资金。 |
科罗拉多大学癌症中心(UCCC)生物统计和生物信息共享资源(BBSR)支持癌症相关研究的分析。我们集团为实验室研究、实验治疗研究、人口科学研究和临床试验提供生物统计学和生物信息学专业知识和服务。 |
儿童健康生物统计核心为参与安舒茨医学校园儿童健康研究的调查人员提供生物统计服务。Core为儿童健康研究人员提供研究设计、分析和其他统计服务,并以高补贴的商业模式运作。如果您有任何问题,请随时联系我们寻求支持 |
示例使用 | Compass是多机构集成数据和分析服务的重要来源,旨在改变临床研究、卓越运营、分子发现和个性化医疗中的数据驱动过程。 |
为研究研究创建强大而安全的调查,存储与研究研究相关的HIPAA和FDA监管数据,管理通过REDCap在线调查收集的数据。 |
数据可视化、交互式仪表板、预测建模和实时可视化分析。 |
调查,数据收集,问卷调查 |
创建在线调查,预测智能和统计分析。 |
快速咨询,赠款提案的制定,短期项目分析,以及基金赠款或与您的团队签订合同的合作(FTE)。 |
跟踪协议,团队和每月应计费用,时间轴趋势,人口统计细目。 |
文件存储,文件共享,映射网络驱动器。 |
存储,更新和共享来自任何设备的文件,在多台计算机上同步文件,与科罗拉多大学内外的人合作。 |
存储、组织和共享实验室研究数据和协议。 |
使用户能够在一个地方管理所有协议和受试者,支持临床研究账单合规,简化数据管理和监控,在整个生命周期中轻松跟踪生物标本,改善患者招募和跟踪结果,自动化系统之间的信息流。 |
电子邮件、演示文稿、电子表格、存储和共享文件。 |
存储文件,与校内外用户共享文件。 |
书籍和书籍章节,期刊文章,预印本,数据集,教学材料和开放教育资源,技术报告,海报和幻灯片演示,会议材料,项目和作品集,部门出版物。万博手机版下载 |
高性能的虚拟服务器,从统计和可视化到生物信息处理,深度学习等高级分析需求。 |
备份计算机上的文件,在Mac和PC上运行,恢复丢失或损坏的文件。 |
用于大数据分析的高性能计算,包括图像和生物信息学分析-基因组测序,RNAseq, ATACseq, scRNAseq, WGS, GWAS,空间转录组学。 |
在写作时引用文字处理文档中的引用,以创建格式化的引用和参考书目或独立的参考列表。同步个人计算机和设备之间的引用。与多个合著者和同事协作并共享一个库。 |
TriNetX非常适合高级数据探索和可行性分析。透过“罗盘去识别资料查阅协议”申请查阅资料。在TriNetX中生成的队列可以通过Compass重新识别,同时提供特定于这些队列的数据提取。 |
高性能分析需求,需要符合CMS、HIPAA或NIST 800-171标准的安全计算,处理大数据或多个大型数据集,卸载长期工作负载,在扩展到云或集群环境之前测试理论,在安全、受管理的环境中替换实验室服务器,集中关键研究数据 |
存档已完成项目的研究数据,但必须为监管目的保存。将研究数据归档到连接到科学设备的存储设备上,如基因组测序仪和显微镜图像设备。将研究数据保存在本地计算机和网络连接的存储设备上。与其他机构的同事合作并共享数据。将数据传输到Boulder以利用Alpine高性能计算集群。 |
CRIIU可以在项目的所有阶段提供帮助,从头脑风暴到提案写作和实施。构建支持研究干预所需的Epic工具,包括流程表、bpa警报/触发器、笔记模板、护理路径、风险评分、Smartsets等。以用户为中心的设计(UCD)实现随机化方法和A/B测试方法,确保评估所需的数据可用 |
项目咨询、组学分析、统计分析、研究者发起的临床试验(IITs)和资助援助 |
短期咨询(所有项目免费1小时),提案和协议开发,每小时付费的短期咨询和分析,长期的全职合作。 |
资源网站 | https://pub.healthdatacompass.org/home | https://redcapinfo.ucdenver.edu/ | https://www.cu.edu/uis/service-catalog/tableau | https://forms.ucdenver.edu/ | https://www1.ucdenver.edu/offices/office-of-information-technology/software/how-do-i-use/qualtrics | http://cida.ucdenver.edu/ | //www.dc-118.com/insights | https://www1.ucdenver.edu/offices/office-of-information-technology/services | https://www1.ucdenver.edu/offices/office-of-information-technology/software/how-do-i-use/onedrive | https://www.labarchives.com/ | http://www.ucdenver.edu/OnCore | https://www1.ucdenver.edu/offices/office-of-information-technology/software/how-do-i-use/office-365 | https://som.egnyte.com | https://digitalcollections.www.dc-118.com/ | https://pub.healthdatacompass.org/home | https://www.crashplan.com | https://www.colorado.edu/rc/alpine | https://library-cuanschutz.libguides.com/endnote | https://www.healthdatacompass.org/data-delivery-services | https://medschool.www.dc-118.com/slce/ | https://www.colorado.edu/rc/resources/petalibrary | https://medschool.www.dc-118.com/accords/about/d2v/what-we-do/CRIIU | https://medschool.www.dc-118.com/colorado-cancer-center/research/shared-resources/biostatistics-and-bioinformatics | https://medschool.www.dc-118.com/pediatrics/research/programs/biostatistics-support |
数据分类 | 高度机密的 |
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联系 | 健康数据罗盘 healthdatacompass@ucdenver.edu |
阿曼达·米勒 redcap@ucdenver.edu |
UIS服务台 303-860-4357 irmhelp@cu.edu |
OIT帮助台 303-724-4357(或4-HELP) oit-servicedesk@ucdenver.edu |
OIT帮助台 303-724-4357(或4-HELP) oit-servicedesk@ucdenver.edu |
加拿大国际发展署管理 cida@ucdenver.edu |
OnCore管理 OnCoreSupport@ucdenver.edu |
OIT服务台 303-724-4357 oit-servicedesk@ucdenver.edu |
OIT服务台 oit-servicedesk@ucdenver.edu |
马修Steinbeiss 303-492-5031 matthew.steinbeiss@www.dc-118.com |
OnCore管理 OnCoreSupport@ucdenver.edu |
OIT服务台 oit-servicedesk@ucdenver.edu |
Dalan詹森 support@medschool.zendesk.com |
施特劳斯图书馆 consultations@www.dc-118.com |
健康数据罗盘 healthdatacompass@ucdenver.edu |
Support@medschool.zendesk.com Support@medschool.zendesk.com |
研究及计算支援 rc-help@colorado.edu |
施特劳斯图书馆 consultations@www.dc-118.com |
健康数据罗盘 healthdatacompass@ucdenver.edu |
医学院-安舒茨医学院 Dalan.Jensen@Cuanschutz.edu |
研究及计算支援 rc-help@colorado.edu |
瑞秋Zucker 303-724-9222 Rachel.zucker@www.dc-118.com |
ccbiostatistics@UCDENVER.EDU Bioinformatics@CUAnschutz.edu |
克里斯汀·米勒(运营经理);劳拉·派尔(主管,laura.pyle@www.dc-118.com) kristen.miller@www.dc-118.com |
成本 | 校园支援服务 |
校园支援服务 |
中央支持-无成本 |
校园支援服务 |
校园支援服务 |
变化-基于项目范围和复杂性 |
校园支援服务 |
.025美元/ GB /月25美元/结核病/月 |
校园支援服务 |
校园支援服务 |
校园支援服务 |
校园支援服务 |
每个用户每年150美元 |
免费的图书馆支持的资源 |
为服务付费(基于使用情况) |
每个用户60美元,每个用户可以备份4台设备 |
无成本(中央支持) |
免费校园支持资源 |
校园支援服务 |
一次性和持续成本 |
$45/TB/年(需预先购买最少2TB) |
项目相关的 |
取决于项目类型、范围和UCCC状态 |
松鼠皮 |