CU Anschutz研究人员参加了突出COVID-19风险因素的大型基因组分析

2020年3月，来自世界各地的数千名科学家，包括来自科罗拉多个性化医疗中心联合起来回答了一个紧迫而复杂的问题:是什么遗传因素影响了为什么一些COVID-19患者患上了严重的、危及生命的疾病，需要住院治疗，而另一些患者则只有轻微症状或根本没有症状?

他们对迄今为止的发现进行了全面总结，发表于《自然》，揭示了人类基因组中与感染或严重COVID-19密切相关的13个位点。研究人员还发现了吸烟和高体重指数等致病因素。这些结果来自有史以来规模最大的全基因组关联研究之一，其中包括近5万名COVID-19患者和200万未感染对照。

这些发现可能有助于为未来的治疗提供靶点，并说明遗传研究在了解更多传染病方面的力量。

这项全球性的努力，被称为COVID-19宿主基因组计划，成立于2020年3月安德里亚碰面，组长在芬兰分子医学研究所，赫尔辛基大学而且马克•戴利他是FIMM的导演而且他是麻省理工学院和哈佛大学布罗德研究所的成员。该计划已发展成为人类遗传学领域最广泛的合作之一，目前包括来自25个国家的3300多名作者和61项研究。

合作的努力

为了进行分析，该联盟汇集了来自研究中近5万名病毒检测呈阳性的患者的临床和遗传数据，以及来自众多生物库、临床研究和23andMe等直接面向消费者的基因公司的200万对照数据。

该生物库位于科罗拉多个性化医疗中心(CCPM)，这是一个非营利性卫生系统之间的合作伙伴关系UCHealth和科罗拉多大学安舒茨医学院他是美国为这些研究做出贡献的四个生物库之一。CCPM生物库正在积极生成基因组数据，并将见解与电子健康记录相结合，构成了美国最大的机构生物库之一。目前，CCPM有超过18万名研究参与者同意积极招募，为数十万uchealhealth患者开发全面的临床和研究资源。

“我们很荣幸参与一项研究，使我们能够了解与COVID-19大流行相关的遗传过程，并在这样的合作努力中利用CCPM的巨大资源，”CCPM研究主任、芝加哥大学生物医学信息学和个性化医学部副教授Chris Gignoux博士说科罗拉多大学医学院．

Gignoux说:“像这样的全球范围的努力突出了大规模生物银行作为世界开放资源的优势和必要性。”“我们很高兴其他研究可以很容易地利用我们在这里学到的东西，我们当然有兴趣继续追求这一点。我们还可以利用这些信息来确定与疾病相关的生物途径，并有望确定未来治疗的新候选药物。”

由于从世界各地涌入的大量数据，科学家们能够比任何一个群体单独获得的数据更快地、从更广泛的人群中得出统计上可靠的分析。

利用多样性

在迄今为止该团队确定的13个位点中，有两个在东亚或南亚血统的患者中比欧洲血统的患者中频率更高，这强调了遗传数据集多样性的重要性。戴利说:“我们在基因多样性采样方面比过去的努力要成功得多，因为我们齐心协力地接触到世界各地的人群。”“我认为我们还有很长的路要走，但我们正在取得很好的进展。”

研究小组特别强调了这两个位点中的一个，靠近FOXP4基因，该基因与肺癌有关。与严重COVID-19相关的FOXP4变体增加了该基因的表达，这表明抑制该基因可能是一种潜在的治疗策略。与严重COVID-19相关的其他基因座包括DPP9，一种也与肺癌和肺纤维化有关的基因，以及TYK2，一种与一些自身免疫性疾病有关的基因。

戴利说:“我们的目标是在明年得到一些非常具体的治疗假设。”“现实地说，我们很可能会在很长一段时间内将COVID-19作为严重的健康问题来处理。今年出现的任何治疗方法，比如基于明确的遗传学见解重新利用现有药物，都将产生巨大影响。”