基因组研究目标罕见的儿童免疫紊乱

免疫学的研究人员领导的多机构研究项目安舒茨医学科罗拉多大学校园重点是潜在疾病先天性免疫机制(迅速),这可能最终帮助找到治疗这些高风险患者。

迅速的很少见,往往危及生命的免疫系统紊乱,导致感染易感性、炎症、自身免疫、过敏,和/或癌症。迄今为止,近500人迅速的识别和描述,和持续增长的临床表型列表是更好的定义。

这项研究是由250000美元的飞行员桑福德儿童基因组医学联盟授予的首席调查员埃琳娜谢医学博士,副教授免疫学和微生物学和儿科,卡伦Dutmer医学博士,副教授pediatrics-allergy /免疫学,两个铜医学院。

谢长廷和Dutmer提供保健过敏和免疫学中心科罗拉多州儿童医院,开展基础科学研究侧重于理解和描述提供控制炎症免疫反应迅速的并发症。

全基因组测序解决未满足的需求

项目旨在识别小说遗传缺陷和独特的临床表型已知迅速使用全基因组测序(WGS)。这笔赠款将允许WGS长达25疑似迅速的患者,与提供的样品从联盟的10个成员国的儿童医院,包括科罗拉多州儿童医院。

“什么罕见,迅速的很难研究和诊断,”谢说。“如果你不知道它是什么样子,因为它是不清楚甚至还没有被发现,很难到达诊断。”

由于不同临床表型的迅速,没有一个直接的路径后病人的诊断调查经常莫名其妙出现症状。病人可能拜访几位专家和subspecialists并接受多个测试最终被诊断出(或者更糟,确诊是从来没有达到)。

“在诊断的情况下,长时间的延迟从出现症状到最终确定一个潜在的病因临床管理不佳,有时翻译有害的医疗干预,”谢说。

WGS利用广泛的基因测序技术,允许。与单基因测序,定制基因测序面板,或全外显子组测序(韦斯),WGS本质上包含所有个体的遗传物质。这种方法不仅可以发现的突变基因以前与迅速的无关,但也提供了一个方法的临床表型和描述已知的迅速扩张。

“虽然迅速的很少,他们是病因,“Dutmer说。“当我们诊断一个人的天生的错误免疫力,它可以极大地影响我们如何对待他们,并对他们的预后也通知我们。”

一个多学科,多努力

项目利用联盟成员的专长在免疫系统表征,基因组学和变异分析WGS数据的及时和专家的解释。当前研究的预期成果之一是识别和多模型研究的发展迅速,基于集体免疫学临床和基础科学知识。

“如果你正试图研究罕见疾病,很难专注于一个机构,即使你是一个地区或国家转诊中心像我们在科罗拉多州儿童,”谢说。“更多的机构可以齐心协力,更高的几率产生影响。”

医院的几个成员已经确定患者临床历史和初步诊断评估迅速的暗示,但尚未达到明确诊断。患者样本已经提交了一个广泛的年龄,从婴儿到年轻人,和更多的样品预计在接下来的几个月里。

一旦选择一个病人的研究中,在样本上执行WGS病人和父母(如果可用),三来提高诊断产量。雷迪管理学院测序样品然后分析儿童在圣地亚哥基因组医学研究所。

梳理数据有意义的线索

“WGS提出了。我们必须梳理大量的数据来寻找有意义的事情,”谢说。
基因突变鉴定在这个项目的测序情况下导致明确诊断;然而,病人保密防止细节被共享。诊断病人将收到一个治疗计划从他们所指的机构,开始一个个性化的治疗方案。

如果WGS识别变异不确定的意义,样本可能被用于临床免疫诊断研究或研究导向的验证分析,包括t细胞受体信号传导和细胞因子信号,谢长廷的实验室进行。

漫长的游戏:驾驶更好的结果

Dutmer相信这种创新基因组医学研究提供个性化护理的临床应用潜力巨大。

“我有希望改善患者的结果。我们有几个情况我们希望结果是不同的,我们做的最好的,但是我们尝试的治疗干预措施不成功,”Dutmer说。“我们可以调整我们的治疗策略,我们的结果就会越好。”

除了改善预后和治疗这些病人,谢长廷是乐观地认为这项研究将有助于罕见疾病上发光。

“我希望我们的工作导致罕见的小儿免疫疾病的改善意识,”她说。“对于父母来说,可以隔离,因为你可能需要移动你的家人更接近专门照顾你的孩子。没有立即“灯泡”别人的理解和支持。”

客座撰稿人:杰西卡·埃尼斯是一个作家专门从事医疗和科学。