劳拉·萨巴

劳拉萨巴博士学位
副教授
电子邮件: laura.saba@www.dc-118.com
电话: 303-724-9697
saba-research-interests

我的研究兴趣集中在开发和实施系统遗传学统计模型到复杂的特征。目前在实验室里我们正在几个不同的项目:

  1. 定性和定量的分析方法从RNA-Seq数据记录(非编码和编码)
  2. 网络分析的RNA表达分析
  3. 数量性状位点(QTL)定位分析行为,生理和分子特征(例如,RNA表达)
  4. 分析定量蛋白质组学分析
  5. 遗传药理学和药物动力学
  6. 遗传学分析结果的可视化系统
  7. 多种类型的组学数据的集成

我的大多数研究遗传易感性研究酒精依赖在动物模型中,特别是在重组纯系小鼠和大鼠的面板。产生的数据和分析结果PhenoGen网站上下载或交互式图形一样简单。

正在进行的投资项目在实验室包括:
  1. 识别与酒精代谢相关的基因通路HXB / BXH重组近交面板(NIH-NIAAA: R24 AA013162)
  2. 应用贝叶斯网络模型从RNA-Seq RNA表达水平和DNA序列信息构建预测模型(NIH-NIAAA: R24 AA013162)
  3. 整合microrna在lx和mRNA表达数据小组,调查基因番茄的酒精依赖相关的表型(NIH-NIAAA R01 AA021131;π-怀中Kechris)
  4. 识别基因和基因网络参与调控随机确定R7感光细胞命运在果蝇基因参考面板(NIH-NEI一下R21 EY024413;π-史蒂夫·布瑞特)
  5. 阐明基因的作用在柱状细胞反应工程纳米材料暴露使用全基因组关联分析和转录组和混合鼠标多样性面板(NIH-NIEHS R01 ES019311;π-贾里德·布朗)
  6. 使用RNA-Seq识别基因通路与癫痫神经元兴奋性组织(SSPPS ADR飞行员格兰特莫莉洪博培和布伦特原油O ' neill)
  7. 识别基因预测心脏移植后的移植物血管病变(SSPPS ADR飞行员与克里斯蒂娜Aquilante和罗伯特页面)
mammalian-genome

系统遗传学

  • Harrall KK, Kechris KJ, Tabakoff B,霍夫曼PL,海因斯LM,冢本H, Pravenec M, Printz M,萨巴LM。发现肝脏在通过RNA co-expression网络免疫力的作用。Mamm基因组。2016年10月,27 (9):469 - 84。
  • 萨巴LM,Flink SL, Vanderlinden LA,以色列Y, Tampier L,科伦坡G, Kiianmaa K,贝尔RL, Printz MP, Flodman P, Koob G,理查森HN,霍夫曼PL, Tabakoff b .转录组测序老鼠大脑,其使用识别网络诱发饮酒。2月j . 2015年9月,282 (18):3556 - 78。
  • 拉森贝内特B, C,里士满P, Odell,萨巴L,Tabakoff B,雷德克里夫道R, R . QTL定位的急性功能公差在lx重组菌株近亲繁殖。酒精实验研究杂志2015年4月,39 (4):611 - 20。
  • Vanderlinden洛杉矶,萨巴LM贝内特B,霍夫曼PL Tabakoff B的影响性遗传的监管在黑暗中饮酒饮酒。Mamm基因组。2015年2月,26 (1 - 2):43-56。
  • 霍夫曼PL,萨巴LM格雷厄姆写新泽西,Flink年代,Kechris K, Tabakoff b基因的基因表达特征响应为酒精偏好选择育种。大脑Behav基因。2014年11月,13 (8):743 - 57。
  • Vanderlinden L,萨巴LPrintz, M, Flodman P, Koob G,理查森H,霍夫曼P, Tabakoff b .酒精剥夺效应介导的基因吗?研究与HXB / BXH重组近亲繁殖老鼠菌株。酒精Exp Res 2014 7月,38 (7):2148 - 57。
  • Vanderlinden洛杉矶,萨巴LM,霍夫曼PL Kechris K Tabakoff b基因co-expression网络提供洞察饮酒的遗传因素。《公共科学图书馆•综合》2013年7月23日,8 (7):e68878。*这个刊物是一个学生的论文工作的结果。

通路分析在蛋白质组学分析的蛋白质的修改

  • Shearn CT, Orlicky DJ,萨巴LM博士Shearn啊,彼得森,增加肝细胞蛋白质羰基化反应在人类终末期酒精性肝硬化。自由·拉迪奇生物医学杂志。2015年10月27日。pii: s0891 - 5849 (15) 01089 - 8。
  • Shearn CT, Fritz KS Shearn啊,萨巴LM美世客,缘起B,加利根JJ, Zimniak P, Orlicky DJ, Ronis MJ,彼得森博士删除GSTA4-4导致增加线粒体蛋白质的翻译后修饰活性醛后慢性乙醇消费在老鼠身上。氧化还原医学杂志2016年4月;7:68 - 77。
  • 考夫兰C,沃克DI, Lohr K, Lazo CR,理查森小,萨巴LM,粥汤WM Fritz KS Roede JR .羰基化作用的比较蛋白质组学分析蛋白质治疗小鼠纹状体和皮质的农药。帕金森氏病夺去2015;2015:812532。

人类基因关联研究

  • 左左,萨巴L张x - y,克里斯托JH, Tabakoff B,罗x重要的稀有IPO11-HTR1A变体之间的联系和注意缺陷多动障碍的白种人。地中海是J麝猫B Neuropsychiatr麝猫。2015年10月,168 (7):544 - 56。
  • 左左,萨巴L、王K,张XY,克里斯托JH, Tabakoff B,罗x Exome-wide协会研究复制产生的变异赋予酒精依赖的风险。J螺栓酒精药物。2013年7月,74 (4):622 - 5。
  • 普•罗科皮D萨巴LWalter H, Lesch O,斯卡拉K, Schlaff G, Vanderlinden L,克拉普P,霍夫曼P, Tabakoff b基因标记阶段抑郁症和酗酒的女性。酒精实验研究杂志2013年6月,37 (6):896 - 904。

生物标记物

  • 斯奈尔LD、Ramchandani VA萨巴L,海洛因D, Heilig M,乔治DT, Pridzun L, Helander, Schwandt ML,菲利普斯MJ,霍夫曼PL, Tabakoff B;和世卫组织/ ISBRA研究状态和特征标记的酒精使用和调查人员的依赖。酒精消费的生物测量。酒精Exp Res 2012 2月;36 (2):332 - 41。
KylieHarrall 凯莉Harrall,女士
专业研究助理

凯莉双主修生物学和化学密苏里-堪萨斯城大学,做了以下5年研发兽医疫苗勃林格殷格翰的发言Vetmedica和弗吉尼亚理工大学。渴望了解更多关于数据分析,凯莉回到丹佛科罗拉多大学的研究生院,并完成了她在生物统计学的女士。萨巴的实验室,她花时间处理高通量组学数据集;这项工作包括RNA-Seq和微阵列数据的集成和解释,和新技术的发展和探索增加组学数据的可解释性。
RyanLusk Ryan Lusk废话
博士生

瑞安毕业于明尼苏达大学德卢斯,生物化学和分子生物学学士学位。作为一个大学生,他的研究包括超临界流体色谱方法开发、生物物理特性的内在无序蛋白质,和技术的发展,检查光通量在激流的系统。瑞安进入制药科学——丹佛科罗拉多大学的博士项目在2015年。在研究生院,瑞恩发现生物统计学的激情,和他的论文工作旨在结合他的生命系统知识来解释大,临床相关的数据集,以帮助回答当今复杂的生物医学科学问题。
HarrySmith 哈里·史密斯,废话
英里/小时的学生

哈利赢得了他的学士科学生物学在科罗拉多斯普林斯,科罗拉多州大学的,目前正在追求他的公共卫生硕士从科罗拉多在Anshutz医疗公共卫生学院的校园。主人的浓度是应用生物统计学和生物信息学。他的研究兴趣包括使用系统遗传学的遗传关联研究,以及机器学习的环境中健康和健康结果数据。最近,他加入了萨巴实验室Skaggs药学和制药科学学院第一次实习之后,被聘为学生员工。他正在调查基因影响褐色脂肪组织的代谢活动(蝙蝠)基因co-expression网络与有趣的代谢表型有关。
LaurenVanderlinden 劳伦·Vanderlinden女士
专业高级研究助理

劳伦为她赢得了化学和数学学士学位从铜博尔德和女士从加州大学生物统计学丹佛。之前在药店的学校工作,劳伦是一个专业研究助理在医学院的蛋白质组学的核心和专业质谱分析。她目前的研究兴趣包括应用统计方法来整合各种高通量数据和生理特征数据。统计上确定的遗传和环境基础疾病是她研究的最终目标。

精密医学是一个多学科领域,科学家们的合作与多样化的技能。萨巴实验室,我们应用生物统计学,生物信息学,统计遗传学,和遗传药理学技术发现疾病的生物机制,识别可能的药物目标,确定亚种群,将受益于特定的药物治疗或预防战略。

因为我们研究领域的多学科性质,我们感兴趣的一个广泛的学生和博士后研究人员。

有关更多信息,请联系萨巴博士关于下列:

  • 旋转/论文项目/统计制药科学指导博士生
  • 旋转/论文项目/毒理学统计指导博士生
  • 论文/女士论文项目生物统计学和博士生
  • 遗传学和生物信息学博士后研究系统