抗逆转录病毒发现、评估和应用研究(ADEAR)培训计划

申请，其中包括以下文件，必须通过以下链接以电子方式提交．如有任何问题，请通过brandi.dolan@www.dc-118.com联系Brandi Dolan。

应用在这里

应用程序项目：

1. 候选人的意向书，包括对学术生涯的兴趣、对从事艾滋病相关研究的承诺，以及在拟议的两年资助期内的培训计划。限制2页．
2. 申请人的简历、简历或NIH生物简介。
3. 导师的NIH生物简介，包括目前的资金。
4. 推荐信(共4封)，其中1封来自拟议的博士后导师(如果是联合导师)。
5. 职业发展计划(限制1页）.
6. 项目描述从候选人(字体Arial 11，½”空白)。限制3页．(a)具体的目标/假设，(b)背景，(c)简要的实验方法，(d)简要的研究活动时间表和研究的预期最终产品(跨度可能为两年的资助)。
7. 引用(限制1页，不包括项目说明)。
8. 负责任的研究行为(具体要求见:https://www.niaid.nih.gov/research/responsible-conduct-research-training）.限制1页．
   

一个。格式:必须包括学员之间的面对面(根据机构指南，通过缩放或面对面)讨论(案例研究)。

b。主题．

c。教师参与:非常鼓励培训教师参与正式/非正式的教学。

d。授课时间:至少8小时的接触教学(学期系列优先)。

e。教学频率:每个职业阶段至少一次和/或每4年一次。

奖项:

• NIH研究部分格式将用于对申请进行排名。

联合项目主任:Thomas Campbell，医学博士医学与微生物学教授(UC-AMC)．坎贝尔博士的研究重点是抗逆转录病毒药物治疗艾滋病毒/艾滋病的临床研究，他曾与来自不同学科和其他机构的研究人员合作。研究兴趣包括对抗逆转录病毒治疗反应的性别差异，简化剂量对抗逆转录病毒药物依从性的影响，传播和获得性抗逆转录病毒药物耐药性的后果，营养不良对抗逆转录病毒药物反应的作用，以及在资源有限的环境中合并感染、慢性炎症和免疫激活的影响。

电子邮件:THOMAS.CAMPBELL@CUANSCHUTZ.EDU

学院网站:https://som.ucdenver.edu/Profiles/Faculty/Profile/4502

联合项目主任:Mamuka Kvaratskhelia博士，医学教授(UC-AMC)．Kvaratskhelia博士是一位生物化学家、药理学家和分子病毒学家，他开发了一个非常互动的研究项目，包括基础科学和转化成分。他一直在开发和阐明一种全新的抗病毒药物的作用模式，称为变构HIV-1整合酶抑制剂，用于其潜在的临床应用。

电子邮件:MAMUKA.KVARATSKHELIA@CUANSCHUTZ.EDU

学院网站:https://medschool.www.dc-118.com/infectious-diseases/faculty/id-faculty/mamuka-kvaratskhelia

项目副主任:Kristine Erlandson，医学博士医学副教授，传染病学部(UC-AMC)．Erlandson博士研究了抗逆转录病毒治疗过程中衰老的并发症，特别是慢性HIV感染和炎症反应失调导致早期虚弱和身体功能下降的机制，尽管抗逆转录病毒治疗取得了成功。她已经确定了炎症和免疫激活标志物与虚弱之间的强烈关联。最近的研究评估了24周的中等强度和高强度运动对身体功能的影响，这些影响是通过包括炎症(IL-6, TNF-α)、免疫激活(sCD14, sCD163)和胰岛素样生长因子(IGF)-1通路在内的生物标志物的变化介导的。Erlandson博士也是一项R01基金的PI，研究吡伐他汀对抗逆转录病毒治疗艾滋病毒患者肌肉功能和肌内脂肪的影响，她正在开发一个新项目，研究整合酶抑制剂治疗期间体重增加的机制。

电子邮件:KRISTINE.ERLANDSON@CUANSCHUTZ.EDU

学院网站:https://som.ucdenver.edu/Profiles/Faculty/Profile/6113

Lisa Abuogi，医学博士传染病科儿科助理教授(UC-AMC)．Abuogi博士的研究重点是在资源有限的情况下改善艾滋病毒预防和治疗的实施科学。她对肯尼亚感染艾滋病毒的儿童中结核病合并感染的发病率和流行率进行了研究。她目前是一项大型多地点社区随机研究的PI，该研究旨在最大限度地提高肯尼亚B+方案背景下妇女和婴儿的保留率和依从性。这包括评估一项大规模多成分干预措施，以迅速改善肯尼亚西部的预防母婴传播服务，评估家庭检测以确定感染艾滋病毒的儿童，以及评估艾滋病毒感染儿童开始治疗的延迟。

电子邮件:Lisa.Abuogi@childrenscolorado.org

学院网站:https://som.ucdenver.edu/Profiles/Faculty/Profile/21129

Ramesh Akkina博士微生物学、免疫学和病理学(CSU)教授．Akkina博士的研究重点是人源化小鼠模型，用于评估艾滋病毒治疗和预防的新方法。他在兽医和医学领域的基础和应用传染病研究方面有超过35年的经验。他帮助完善了几个基因转移方案，并主要负责开发SCID-hu小鼠模型，移植人体组织用于干细胞重建和基因治疗。他的团队是第一批用VSV-G包膜伪分型hiv慢病毒载体并实现高效基因转导到CD34造血祖细胞的团队之一。他的实验室已经适应了新的RAG-hu小鼠模型，具有多谱系人类造血和人类免疫反应的能力，用于研究艾滋病毒感染和发病机制。Akkina博士在以下方面为受训者提供指导:在HIV治疗和预防研究中使用动物模型，设计和利用sirna /RNAi进行基因敲除，使用逆转录和慢病毒载体进行基因转移和治疗，从人类胚胎干细胞中提取造血细胞，以及基因转移到造血干细胞的技术。

电子邮件:Ramesh.Akkina@colostate.edu

学院网站:http://www.cvmbs.colostate.edu/DirectorySearch/Search/MemberProfile/CVMBS/3131/Akkina/Ramesh

Peter Anderson，药学博士。药理学教授(UC-AMC)．安德森博士的研究兴趣是抗逆转录病毒药物的临床药理学。他的实验室在测量、解释和分析细胞外和细胞内抗逆转录病毒药物浓度方面具有专业知识在活的有机体内．他研究了抗病毒治疗的药代动力学因素，包括改变药代动力学的生物因素和改变药代动力学对药物疗效和毒性的影响。正在进行的替诺福韦和恩曲他滨在艾滋病毒阴性和艾滋病毒阳性人群中的细胞药理学研究，为艾滋病毒治疗和预防提供最佳剂量策略，是一个可以为ADEAR学员提供研究培训机会的项目的一个例子。

电子邮件:PETER.ANDERSON@CUANSCHUTZ.EDU

学院网站:https://pharmacy.www.dc-118.com/about-us/faculty-and-staff-directory/peter-anderson

Jose Castillo-Mancilla，医学博士医学副教授，传染病学部(UC-AMC)．Castillo-Mancilla博士是一名应用抗逆转录病毒临床药理学的转化研究员，重点研究抗逆转录病毒药物的依从性、当前抗逆转录病毒疗法的优化、药物基因组学和暴露前预防(PrEP)。他是ACTG研究A5359的首席研究员，这是一项正在进行的多位点研究，旨在评估长效抗逆转录病毒药物对非粘附个体的疗效。Castillo博士的研究兴趣还包括西班牙裔的抗逆转录病毒治疗，包括研究如何解决对西班牙裔外展项目的评估和发展的持续需求，以减少这一人群的艾滋病毒发病率，并改善治疗的可及性。

电子邮件:JOSE.CASTILLO-MANCILLA@CUANSCHUTZ.EDU

学院网站:https://som.ucdenver.edu/Profiles/Faculty/Profile/18367

陈朝平博士生物化学与分子生物学(CSU)副教授．Chen博士的实验室使用基于细胞的检测方法来研究HIV蛋白酶前体的自动加工，作为表型评估的快速工具，以评估蛋白酶编码区以外的突变对蛋白酶表型的影响。ADEAR学员的潜在项目包括基于实验室的研究，从基于蛋白酶抑制剂治疗的患者的临床标本中表征蛋白酶自处理表型，以及自处理表型与蛋白酶抑制剂病毒学反应之间的相关性。

电子邮件:Chaoping.Chen@colostate.edu

学院网站:https://www.bmb.colostate.edu/about/people/person/?id=B7AF5E0E1EC353F92840DA5A9246D31C&sq=t

克里斯托弗·德苏扎博士，综合生理学教授(UCB)．德苏扎博士是博尔德校区CCTSI网站的联合主任。他的实验室研究心血管和代谢风险因素以及生活方式干预对成人血管内皮细胞功能的影响。具体感兴趣的领域包括:内皮血管舒缩调节的调节;内皮纤维蛋白溶解控制;内皮功能的血浆蛋白质组学标记;内皮祖细胞功能;以及运动和抗氧化补充剂对内皮健康和功能的影响。DeSouza博士此前研究了HIV感染和抗逆转录病毒治疗对血管内皮功能的影响，以深入了解导致HIV血清阳性成人心血管疾病负担增加的潜在机制。一个正在进行的项目正在确定短时间睡眠对HIV-1治疗中血管内皮细胞功能的影响，并将为对抗逆转录病毒药物心血管并发症感兴趣的学员提供临床和转化研究的培训机会。

电子邮件:desouzac@colorado.edu

学院网站:https://www.colorado.edu/iphy/people/professors/chris-desouza

Edward N. Janoff，医学博士医学教授，传染病学部(UC-AMC)．Janoff博士研究诱导系统和粘膜反应链球菌引起的肺炎抗逆转录病毒治疗期间的感染和疫苗接种，胶囊特异性抗体反应的分子基础(VH基因多样性和突变模式)，以及这些人抗体的功能活性。他的团队描述了粘膜反应年代．肺炎以及肠道、生殖道和母乳中的HIV病毒。每项研究都得到了非洲(乌干达、布基纳法索、博茨瓦纳和南非)一个实地站点的支持，合作者来自这些非洲国家、美国和欧洲。Janoff博士是ADEAR学员的导师，他们对抗逆转录病毒治疗期间在粘膜表面研究宿主- hiv相互作用的临床和基本实验室方法感兴趣。

电子邮件:EDWARD.JANOFF@CUANSCHUTZ.EDU

学院网站:https://som.ucdenver.edu/Profiles/Faculty/Profile/15947

Jennifer Kiser，药学博士。药理学副教授(UC-AMC)．Kiser博士是一名抗病毒临床药理学家，他与抗病毒药物进行浓度效应和药物-药物相互作用研究。Kiser博士最近和正在进行的项目包括替诺福韦的血浆和细胞内药代动力学评估，替诺福韦和洛匹那韦/利托那韦药物相互作用的肾机制探索，HIV感染孕妇的浓度引导洛匹那韦/利托那韦给药，与HIV蛋白酶抑制剂和HMG-CoA还原酶抑制剂(他汀类药物)相互作用的评估，以及在体外恩替卡韦和利巴韦林之间细胞内药物-药物相互作用潜力的测定。Kiser博士是对研究抗逆转录病毒药物药理学感兴趣的ADEAR学员的导师。

电子邮件:JENNIFER.KISER@CUANSCHUTZ.EDU

学院网站:https://pharmacy.www.dc-118.com/about-us/faculty-and-staff-directory/jennifer-kiser

劳蕾尔·伦茨博士免疫学与微生物学教授(UC-AMC)．Lenz博士的研究重点是更好地理解先天免疫反应在健康和疾病的背景下是如何被调节和失调的。最近的一次合作。Lenz和Weinberg发现，艾滋病毒感染母亲所生的未感染艾滋病毒的婴儿，在子宫内接触抗逆转录病毒药物，会改变NK细胞比例、表型和功能，出生时NK细胞细胞毒性失调，包括IFNγ和穿孔素产生减少。这些发现提供了一种免疫机制来解释为什么暴露于艾滋病毒的婴儿更容易感染。Lenz博士是ADEAR学员的导师，他们对研究用于艾滋病毒治疗或预防的抗逆转录病毒药物对先天免疫反应的影响感兴趣。

电子邮件:LAUREL.LENZ@CUANSCHUTZ.EDU

学院网站:https://medschool.www.dc-118.com/immunology-and-microbiology/faculty/lenz

Myron J. Levin，医学博士儿科和医学教授，传染病科(UC-AMC)．莱文博士的研究兴趣是儿童、青少年和孕妇的抗病毒治疗，特别是疫苗免疫学。他是科罗拉多州儿童医院impact网络临床研究站点的联合pi。他正在与博士合作。Campbell和Castillo-Mancilla在一项新诊断感染艾滋病毒的青少年和成人早期抗逆转录病毒启动的随机临床试验中进行了研究。潜在的研究项目包括研究治疗和预防儿童和青少年艾滋病毒感染的新型抗病毒药物，预防艾滋病毒母婴传播，以及评估抗逆转录病毒疗法对疫苗免疫反应的影响。

电子邮件:MYRON.LEVIN@CUANSCHUTZ.EDU

学院网站:https://som.ucdenver.edu/Profiles/Faculty/Profile/18048

凯瑟琳·洛祖彭博士生物信息学和个性化医学部医学助理教授．Lozupone博士研究在健康和疾病中形成人类微生物组组成的因素，并调查组成差异的功能后果，包括单个细菌的生物/代谢特性和宿主相互作用。她是UniFrac算法的主要开发者，该算法使用系统发育信息比较许多样品中的微生物多样性，并且是QIIME软件包的贡献者。在最近和正在进行的R01资助的研究中，她调查了接受抗逆转录病毒治疗的艾滋病毒感染者的肠道菌群组成是否与代谢性疾病有关;微生物组组成差异在多大程度上是由诱导CD4+ T调节细胞的细菌的损失引起的;以及美国和津巴布韦HIV感染者饮食和疾病之间的相互作用。在她的指导下，学员可以使用16S rRNA分析、比较基因组学和元分析来研究HIV感染时微生物组的变化，以及肠道微生物组、慢性炎症和HIV感染易感性之间的关系。

电子邮件:CATHERINE.LOZUPONE@CUANSCHUTZ.EDU

学院网站:https://som.ucdenver.edu/Profiles/Faculty/Profile/21289而且https://medschool.www.dc-118.com/biomedical-informatics-and-personalized-medicine/labs/lozupone-lab

伊丽莎白·麦克法兰博士儿科教授，传染病科主任(UC-AMC)．麦克法兰博士是儿童医院艾滋病毒项目主任，该项目为受艾滋病毒感染的婴儿、儿童、青年、孕妇和家庭提供服务。她是科罗拉多州儿童医院impact网络临床研究站点的联合pi。麦克法兰博士研究了暴露于艾滋病毒和感染艾滋病毒的婴儿的细胞介导免疫反应的成熟，暴露于艾滋病毒的新生儿对艾滋病毒疫苗的免疫反应，细胞毒性t淋巴细胞在先天性获得性艾滋病毒感染发病机制中的作用，抗逆转录病毒疗法和疫苗的儿童艾滋病毒临床试验。为ADEAR学员提供的潜在研究培训项目包括评估未感染艾滋病毒的婴儿和感染艾滋病毒母亲所生并接触抗逆转录病毒药物的儿童的细胞免疫反应在子宫内．

电子邮件:BETSY.MCFARLAND@CUANSCHUTZ.EDU

学院网站:https://som.ucdenver.edu/Profiles/Faculty/Profile/10199

布伦特·帕尔默博士变态反应与临床免疫学系(UC-AMC)副教授．帕尔默博士研究艾滋病毒感染对系统和粘膜免疫的影响，以及抗逆转录病毒治疗期间肠道和肺部共生微生物群与免疫系统之间的相互作用。他的工作已经证明，HIV-1复制通过触发抑制性受体(如PD-1)的过表达来影响T细胞功能，从而诱导T细胞衰竭，并且可以通过使用hiv感染的人源化小鼠模型，通过PD-1途径阻断来逆转这种衰竭，并减少HIV-1复制。他担任ACI/ID流式细胞仪设备的主任，ClinImmune临床免疫实验室还提供了最先进的流式细胞仪仪器。ADEAR的学员将有机会在指导下进行肠道微生物组和粘膜免疫的研究，以及这些粘膜间室之间的相互作用，以及它们在艾滋病毒治疗期间和与男性发生性行为的高危男性中如何相互影响。

电子邮件:BRENT.PALMER@CUANSCHUTZ.EDU

学院网站:https://som.ucdenver.edu/Profiles/Faculty/Profile/3527

Eric Poeschla医学博士医学教授，传染病科主任(UC-AMC)．Poeschla博士是蒂姆吉尔医学教授。他的实验室研究逆转录病毒复制的基本方面，宿主对逆转录病毒的先天免疫，逆转录病毒疾病的发病机制，包括宿主细胞依赖因子，细胞固有的先天免疫/限制因子，整合和辅助蛋白功能。他在LEDGF作为HIV整合辅助因子和HIV-1宿主依赖因子的作用方面做出了基础性工作。Poeschla博士将为ADEAR学员提供与艾滋病毒分子机制相关的治疗艾滋病毒新策略的指导。

电子邮件:ERIC.POESCHLA@CUANSCHUTZ.EDU

学院网站:https://som.ucdenver.edu/Profiles/Faculty/Profile/22141

马里奥·圣地亚哥博士医学副教授，传染病学部(UC-AMC)．圣地亚哥博士的实验室专注于定义先天抗逆转录病毒机制及其对体液和细胞介导免疫反应的影响在活的有机体内，使用三种互补的生物系统。首先，利用遗传工具，他研究了影响小鼠致病性Friend逆转录病毒感染结果的基本先天机制。其次，利用猴免疫缺陷病毒的工程分子克隆，他研究了减弱编码病毒免疫拮抗剂的免疫影响。最后，利用来自对HIV有抗性或易感人群的生物样本，他研究了调节HIV先天抗性的免疫遗传学特性。圣地亚哥博士是ADEAR学员的导师，他们寻求以实验室为基础的对艾滋病毒感染的先天抵抗及其在艾滋病毒预防和治疗中的作用的研究。

电子邮件:MARIO.SANTIAGO@CUANSCHUTZ.EDU

学院网站:https://som.ucdenver.edu/Profiles/Faculty/Profile/593

萨拉·索耶博士分子、细胞和发育生物学副教授(UCB)．索耶博士通过将病毒学的实验室研究与分子进化、群体遗传学、生物信息学和基因组学的工具相结合，研究病毒限制因子和病毒进入受体。她在HIV-1上的工作跨越了十多年，主要集中在细胞水平的进化和病毒与宿主之间的功能相互作用。索耶博士为希望在HIV治疗和预防的背景下研究HIV-1进化的ADEAR学员提供指导研究机会。

电子邮件:ssawyer@Colorado.EDU

学院网站:https://www.colorado.edu/mcdb/sara-sawyer

劳尔·托雷斯博士免疫学与微生物学教授(UC-AMC)．Torres博士研究了B淋巴细胞形成并随后对外来抗原和病原体产生抗体反应的机制。他的研究重点是了解人类和小鼠体内不同的B细胞群如何协同作用，以提供体液免疫，包括边缘区B细胞对艾滋病毒抗体反应的贡献。目前正在进行的工作是研究自动反应性B细胞受体如何识别病原体的表位，并对细菌和病毒(包括艾滋病毒)产生保护性抗体反应。Torres博士将担任ADEAR学员的导师，他们将在基于抗体的艾滋病毒预防和治疗方法的开发和评估方面寻求指导。

电子邮件:RAUL.TORRES@CUANSCHUTZ.EDU

学院网站:https://medschool.www.dc-118.com/immunology-and-microbiology/faculty/torres

琳达·范·戴克博士免疫学和微生物学教授(UC-AMC)．van Dyk博士的研究重点是γ疱疹病毒感染中宿主-病原体相互作用的特征，主要强调潜伏期和再激活。她的实验室研究肿瘤抑制因子对慢性病毒感染的影响，以及慢性感染对肿瘤抑制因子功能的影响。她是希望研究疱疹病毒在艾滋病毒感染抗逆转录病毒治疗期间导致慢性炎症的病毒学机制的ADEAR学员的导师。

电子邮件:LINDA.VANDYK@CUANSCHUTZ.EDU

学院网站:https://medschool.www.dc-118.com/immunology-and-microbiology/faculty/van-dyk

Schuyler Van Engelenburg博士生物科学助理教授(DU)．Van Engelenburg博士在NIH完成了他的博士后培训，在那里他使用单分子成像方法研究了单个HIV-1颗粒是如何在受感染细胞中形成的。他目前的研究使用先进的超分辨率显微镜技术、蛋白质化学和探针开发以及计算图像分析来定量了解HIV-1组装的细胞、生化和遗传驱动因素，并为HIV生物发生构建分子精确的空间和时间模型，以开发针对HIV感染周期组装阶段的新抗病毒疗法。Van Engelenburg博士担任对实验室培训感兴趣的ADEAR学员的导师，以发现或评估艾滋病毒组装抑制剂。

电子邮件:schuyler.vanengelenburg@du.edu

学院网站:https://science.du.edu/about/faculty-directory/schuyler-van-engelenburg

Adriana Weinberg，医学博士儿科和医学教授，传染病科(UC-AMC)．温伯格博士的研究评估了抗逆转录病毒疗法中的免疫恢复。她建立了儿童和成人免疫重建的病毒学相关关系，并确定了艾滋病毒感染患者对巨细胞病毒(CMV)感染的保护的免疫相关关系。她开发了移植患者CMV特异性免疫的几项研究，包括以下:CMV感染对骨髓移植受者移植物排斥-免疫恢复的影响，以及对CMV感染保护的免疫相关性;利用树突状细胞在干细胞和脐带血移植受者中建立cmv特异性免疫。温伯格博士最近描述了艾滋病毒感染者对巨细胞病毒的细胞免疫持续抑制，但在健康个体中没有。ADEAR学员的一个潜在研究培训项目是对接触抗逆转录病毒药物的婴儿细胞免疫抑制的分子机制进行实验室研究在子宫内．

电子邮件:ADRIANA.WEINBERG@CUANSCHUTZ.EDU

学院网站:https://medschool.www.dc-118.com/pathology/department-of-pathology-about-us/faculty/university-of-colorado-anschutz-medical-campus/adriana-weinberg-ucd2245

Cara Wilson医学博士医学教授，传染病学部，医学系教师发展副主席(UC-AMC)．威尔逊博士是一位经验丰富的细胞免疫学家，研究树突细胞和HIV特异性T细胞在控制HIV复制中的作用。她是科罗拉多大学医学家培训项目的副项目主任。威尔逊博士是树突细胞生物学和树突细胞在HIV发病机制中的作用方面的专家。ADEAR学员可以从事以实验室为基础的辅助t细胞和细胞毒性t细胞对HIV的反应、HIV相关树突状细胞依赖性免疫缺陷的机制以及用治疗性HIV疫苗诱导HIV特异性免疫反应的机制的前沿研究。

电子邮件:CARA.WILSON@CUANSCHUTZ.EDU

学院网站:https://som.ucdenver.edu/Profiles/Faculty/Profile/3929

Joshua Barocas医学博士，传染病科医学副教授。Barocas博士领导了一个跨学科的研究项目，该项目旨在改善包括艾滋病毒和丙型肝炎病毒在内的传染病患者、物质使用障碍患者和其他弱势群体的健康状况。他的研究使用临床流行病学、卫生经济学、模拟建模和成本效益，为临床决策和卫生政策提供信息，以回答临床和政策相关的问题。他利用这些创新方法进行研究，以帮助了解政策的影响，并改进政策对感染艾滋病毒、病毒性肝炎和其他传染病或高危人群吸毒的影响。他在传染病和物质使用障碍交叉领域的模拟建模和卫生经济学方面具有特定的专业知识。Barocas博士担任马萨诸塞州愈合社区研究的卫生经济学和建模核心主任，该研究是美国国立卫生研究院资助的多机构拨款，旨在显著减少过量用药。他也是nida支持的物质使用障碍、HCV和HIV治疗干预卫生经济学中心(珍爱)的研究附属机构。

电子邮件:JOSHUA.BAROCAS@CUANSCHUTZ.EDU

学院网站:https://som.ucdenver.edu/Profiles/Faculty/Profile/35747

目前的学员

詹姆斯·柯林博士

项目名称:

同时检测抗hiv和抗siv药物的双用途小鼠模型。

出版物:

1. 施密特K,柯林J， Remling-Mulder L, Moriarty R, Goff K, O'Connor S, Stenglein M, Marx P, Akkina R.模拟SIV黑猩猩病毒在跨物种传播中向HIV-1进化。中华医学灵长类杂志，2020年10月;49(5):284-287。doi: 10.1111 / jmp.12485。Epub 2020 8月17日。PMID: 33460210;PMCID: PMC8177655。
2. 柯林J李志刚，李志刚，李志刚，陈志刚，陈志刚，陈志刚，陈志刚，陈志刚，陈志刚，陈志刚，陈志刚，陈志刚，陈志刚，陈志刚，陈志刚，陈志刚，陈志刚，陈志刚，陈志刚，陈志刚，陈志刚。中华医学灵长类杂志，2020年10月;49(5):280-283。doi: 10.1111 / jmp.12486。Epub 2020 8月10日。PMID: 32777101;PMCID: PMC8162839。
3. 柯林J张晓东，陈晓东，陈晓东，陈晓东，陈晓东，陈晓东，陈晓东，陈晓东，陈晓东，陈晓东，等。SIVcpz在人源化小鼠模型中HIV-1的跨物种传播和病毒进化。中华医学灵长类杂志2020年2月;49(1):40-43。doi: 10.1111 / jmp.12440。Epub 2019 10月1日。PMID: 31576587;PMCID: PMC6942238。
4. 施密特K,柯林J李志刚，李志刚，李志刚，李志刚。SIV黑猩猩祖先病毒对HIV-1病毒在人体内的跨物种传播和进化。前沿微生物。2020年8月11日;11:19 89。doi: 10.3389 / fmicb.2020.01889。PMID: 32849468;PMCID: PMC7432304。
5. 施密特K,柯林J,Kumar DM, Remling-Mulder L, Feely S, Stenglein M, O'Connor S, Marx P, Akkina R. SIV祖细胞对HIV的进化:SIV适应HIV-2的人源小鼠代理模型。中华医学灵长类杂志，2018 10月;47(5):298-301。doi: 10.1111 / jmp.12380。PMID: 30255956;PMCID: PMC6464631。
6. Schmitt K, Charlins P, Veselinovic M, Kinner-Bibeau L, Hu S，柯林J， Remling-Mulder L, Olson KE, Aboellail T, Akkina R.在BLT人源化小鼠模型中寨卡病毒感染和中和人抗体反应。病毒学，2018年2月;515:235-242。doi: 10.1016 / j.virol.2017.12.026。Epub 2018 1月6日。PMID: 29310105;PMCID: PMC5906046。
7. Schmitt K, Mohan Kumar D，柯林J李志刚，李志刚，李志刚，李志刚，等。SIV乌烟白眉猴祖病毒对HIV-2病毒的进化研究。病毒学杂志，2017年10月;510:175-184。doi: 10.1016 / j.virol.2017.07.005。Epub 2017 7月24日。PMID: 28750321;PMCID: PMC5906053。
8. Pope WH, Bowman CA, Russell DA, Jacobs- sera D, Asai DJ, Cresawn SG, Jacobs WR, Hendrix RW, Lawrence JG, Hatfull GF;科学教育联盟噬菌万博手机版下载体猎人推进基因组学和进化科学研究与教育相结合的噬菌体猎人万博手机版下载分枝杆菌遗传学课程。对大量分枝噬菌体的全基因组比较揭示了噬菌体遗传多样性的连续体。Elife. 2015年4月28日;4:e06416。doi: 10.7554 / eLife.06416。PMID: 25919952;PMCID: PMC4408529。
9. Curlin J.(2015)“锯齿跨膜结构域取代对Notch信号通路的影响”。理学学士荣誉论文。三一学院

Brendan Freitas博士

项目名称:

用小分子抑制剂和细胞辅助因子对HIV-1衣壳蛋白(CA)进行低温电镜研究

出版物:

1. Reynolds ND, Aceves NM, Liu JL, Compton JR, Leary DH，Freitas BT， Pegan SD, KZ博士，Wu FY, Hu X, Legler PM。木瓜蛋白酶识别SARS-CoV-2 SSHHPS美国急性呼吸道综合征感染杂志2021年6月11日;7(6):1483-1502。doi: 10.1021 / acsinfecdis.0c00866。Epub 2021 5月21日。PMID: 34019767;PMCID: PMC8171221。
2. Baker CA, Bester SM, Kirkpatrick MG, Boeri MV, Kasten S，Freitas BT， Pegan SD, Otto TC。，Engineering improved stereoselectivity within Brevundimonas diminuta organophosphorus hydrolase for pesticides (Unclassified Title), classified Journal of Chemical and Biological Defense. 2021. 2: 63-78.
3. 兹米安斯基JV，梅斯SL，威廉姆斯IL，Freitas BT， Pegan SD。通过结构突变改变哈扎拉病毒卵巢肿瘤结构域蛋白酶的底物偏好。晶体结构生物学报，2020年11月1日;76(p11):1114-1123。doi: 10.1107 / S2059798320012875。Epub 2020 10月16日。PMID: 33135682;PMCID: PMC7604911。
4. Freitas BT， Durie IA, Murray J, Longo JE, Miller HC, Crich D, Hogan RJ, Tripp RA, Pegan SD。SARS-CoV-2木瓜蛋白酶样蛋白酶去泛素酶和去糖化酶活性的表征及非共价抑制ACS感染疾病2020 Aug 14;6(8):2099-2109。doi: 10.1021 / acsinfecdis.0c00168。Epub 2020 6月4日。PMID: 32428392;PMCID: PMC7274171。
5. Freitas BT， Scholte FEM, Bergeron É， Pegan SD。ISG15如何对抗病毒感染。病毒res 2020 Sep;286:198036。doi: 10.1016 / j.virusres.2020.198036。Epub 2020年5月31日。PMID: 32492472;PMCID: PMC7483349。
6. Dzimianski JV, Scholte FEM, Williams IL, Langley C，Freitas BT，斯宾格勒JR，伯杰隆É， Pegan SD。确定种特异性干扰素刺激基因产物15与奈罗病毒卵巢肿瘤结构域蛋白酶相互作用的分子驱动因素。PLoS One. 2019 12月23日;14(12):e0226415。doi: 10.1371 / journal.pone.0226415。PMID: 31869347;PMCID: PMC6927636。
7. Scholte FEM, Spengler JR, Welch SR, Harmon JR, Coleman-McCray JD，Freitas BT， Kainulainen MH, Pegan SD, Nichol ST, Bergeron É， Spiropoulou CF.单剂量复制子颗粒疫苗可完全保护小鼠对抗克里米亚-刚果出血热病毒。新兴微生物感染，2019;8(1):575-578。doi: 10.1080 / 22221751.2019.1601030。PMID: 30947619;PMCID: PMC6455139。
8. 盛杰，苟伟，陈曦，Freitas B， Paoletti M，冯雪阳。，Data-Driven Prediction of CRISPRBased代谢通量可编程控制的转录调控。arXiv, 2017年4月10日;1704.03027

过去的学员

斯蒂芬妮·贝斯特博士

项目名称:

了解HIV衣壳抑制剂耐药性的结构平台

Lenacapavir，以及开发第二代抑制剂。

出版物:

1. McGuire小,贝斯特尔SM， Guelta MA，张J, Langley C, Winemiller MD, Bae SY, Funk V, Myslinski JM, Pegan SD, Height JJ。g系列神经毒剂对人乙酰胆碱酯酶的抑制和HI-6随后的再激活的结构和生化研究。化学研究毒物。2021年3月15日;34(3):804-816。doi: 10.1021 / acs.chemrestox.0c00406。Epub 2021 2月4日。PMID: 33538594。
2. 贝斯特尔SM， Wei G, Zhao H, Adu-Ampratwum D, Iqbal N, Courouble VV, Francis AC, Annamalai AS, Singh PK, Shkriabai N, Van Blerkom P, Morrison J, Poeschla EM, Engelman AN, Melikyan GB, Griffin PR, Fuchs JR, Asturias FJ, Kvaratskhelia M.一种有效的HIV-1衣壳抑制剂的结构和机制基础。科学。2020年10月16日;370(6514):360-364。doi: 10.1126 / science.abb4808。PMID: 33060363;PMCID: PMC7831379。
3. 贝斯特尔SM。， Adipietro KA。， Funk VL。，Myslinkski J., Keul ND., Cheung J., Wilder PT., Wood ZA.,韦伯DJ。，Height JJ., Pegan SD., The structural and biochemical impact of monomerizing human乙酰胆碱酯酶。蛋白质学报，2019,28(6)，1106-1114。(封面/条)
4. 徐峰，裴世勇。，McGuire J., Anderson DR.,贝斯特尔SM身高JJ。， Pegan SD。， Walz AJ。，Revisiting the synthesis and molecular properties of broad-spectrum nerve agent reactivator HLö-7 dimethanesulfonate. ACS Med. Chem. Lett. 2019, 10 (5) 761-766.
5. 贝斯特尔SM， Guelta MA。，Cheung J., Winemiller MD., Bae SY., Myslinski J., Pegan SD., Height JJ., Structural insights of stereospecific inhibition of human acetylcholinesterase by VX and subsequent reactivation by HI-6. Chem Res Toxicol 2018, 31 (12), 1405–1417. PMID: 30462502. [Featured Article/Cover]
6. 贝斯特尔SM以及Daczkowski C.， Faaberg K.， Pegan SD.。，Insights into PRRSV viral ovarian tumor domain protease specificity for ubiquitin and interferon-stimulated gene product 15, ACS Infect Dis 2018, 4 (9), 1316-1326. PMID: 29856201

奖项:

沃德·史密斯大分子结晶学研究优秀奖