我的创新”,D的结果为Experimentation和一个分析核心专注于大规模的、集成的系统的设计和实现,用于获取和分析神经科学数据。如果你有一个实验的想法,但理想的仪器在商业上没有,那么idea核心在这里可以帮助你。
•修改现有设备或数据分析管道
•复制先前发表的仪器
•设计、组装并交付一种新型设备
•咨询或协助分析数据
“我们的实验室需要一种设备,可以自动将食物颗粒放在柱子上,记录小鼠伸手取食物的情况,并在成功取回食物时以3D方式跟踪手部的闭环刺激。”
——克里斯汀·威尔
“头部混合鼠标在滚轮上运行时,我们需要在全景屏幕上提供可定制的视觉刺激,同时记录鼠标双眼的瞳孔。”
——阿隆·波尔格-波尔斯基和吉顿·费尔森
“我们的实验室需要自动化一项实验,在头部固定小鼠周围的半径范围内,从中心-90°到+90°的不同位置提供水奖励。”
- Diego Restrepo和Abby Person
与ONE核心合作
“我们需要一种用于神经病学诊所的移动设备,可以在医生的帮助下获取患者执行手部运动任务的三维视频。为了符合HIPPA规定,必须在不使用鼠标、键盘或显示器的情况下控制计算机。”
——约翰·汤普森和迪伦·卡莱姆
“我们的实验室需要对受刺激的大鼠坐骨神经进行电生理记录,但我们从未在实验室中这样做过,我们也没有任何所需的设备。”
——苏安杰
“一种已发布的设备是增加某些嗅觉神经元亚型的理想选择,我们手头有一些部件,但我们需要在结构和硬件管理方面的帮助。”
-斯蒂芬·桑托罗
定制数据采集和分析软件
由IDEA核心编写的定制软件可以适应单个实验室的需要。下面的例子展示了一个图形用户界面,它管理摄像头数据采集,也与Arduino通信,Arduino管理外围硬件,如步进电机、伺服器、灯等。
IDEA核心还能够协助对象跟踪和其他类型的分析,最终将结果打包在MATLAB、Python或通用数据结构中。下面的示例是一个图形用户界面,用于管理和分析由Welle实验室实现的CLARA系统获取的数据。
以IDEA为核心开始一个项目
如果你有想要讨论的实验,请发送邮件电子邮件并简要描述了这个想法。在我们的第一次会议上,我们将讨论您实验室感兴趣的生物学问题,并提出一个总体计划。如果任务的新方面需要原理证明,我会进行这些测试,以确认总体战略是可行的。有些项目受益于拥有完整的CAD设计,以确保所有部件都是兼容的,在这种情况下,我会生成该模型。如果各方都对模型、时间表和预计成本感到满意,那么我将继续构建设备并生成管理硬件所需的任何软件。最后,您的实验室可以进行您梦想中的实验!
关于导演
2011年,W. Ryan Williamson从德克萨斯大学西南医学中心获得神经科学博士学位,在P. Robin Hiesinger的实验室研究果蝇感光器的发育。随后,他在格温妮丝·卡德实验室的珍妮莉亚研究园区(Janelia research Campus)从事博士后研究,重点研究果蝇的逃跑行为,在那里他还参与建造了一个2光子显微镜。最近,在安舒茨医学院的克里斯汀·韦勒的实验室,他开发了CLARA系统,这是一种用于研究小鼠伸手行为的闭环自动化设备。在神经生物学的广泛领域进行了研究,IDEA核心的主任希望通过构建适合他们需求的新型数据采集系统,为Anschutz医学校园的行为神经科学实验室服务。
瑞安·威廉姆森博士