去年春天，当世界各地的医疗服务提供者和科学家们争先恐后地治疗感染了一种专家们知之甚少的病毒的大量患者时，有一件事很快变得清晰起来:SARS-CoV-2对人们的影响不同。
大流行早期的临床实践成为了一场激烈的试错游戏，需要在计时器上解决一个巨大的谜题，而每分钟都要付出生命的代价。
现在，在科罗拉多大学安舒茨医学院在那里，当时的研究副校长Thomas Flaig，医学博士有毅力和资源来创建一个生物来自该州首批COVID-19患者的样本，一项有前景的冒险已经出现。
命名为COVIDome项目创造者称这是一种开创性的研究方法，能够加速在世界各地发现拯救生命的COVID-19。该合资企业是研究副校长办公室和中大医学院(SOM)。
“这是一项快速跟踪和加速针对COVID-19精准医学方法的努力，”他说华金·埃斯皮诺萨博士他与弗莱格共同领导了该项目。“除非在个性化医疗的指导下，新冠肺炎的研究没有任何意义。”
“没有两个人是完全相同的”
精准医疗利用个人基因、分子、代谢、生活方式和环境的信息来制定个性化的治疗和预防疾病的措施。它经常用于癌症治疗，在制定治疗计划之前，在分子水平上分析一个人的肿瘤。
埃斯皮诺萨说:“公众需要明白，COVID-19不是一个实体。“COVID-19在个体之间的表现非常不同。为了让我们在临床中有所作为，我们需要了解驱动这种异质性的机制。”
“除非在个性化医疗的指导下，新冠肺炎的研究没有任何意义。”– Joaquin Espinosa, PhD
要做到这一点，科学家们必须深入挖掘。为什么一位祖母几个月来一直依靠呼吸器来生存，而她的丈夫却在家里安然无恙?一个死去的黑人病人和一个有一周类似感冒症状的白人病人的生物样本有什么不同?
“没有两个人是完全一样的，”埃斯皮诺萨说。“我们的基因、新陈代谢和免疫系统都存在重要差异。为什么这个人对这种药物有反应，而这个人没有?”
项目积累了数据集和专家
covid - ome项目成员Kelly Sullivan博士在实验室工作。
这项巨大的合作努力是在校园两家主要医院的帮助下开始的科罗拉多大学医院而且科罗拉多州儿童医院-涉及收集两家医院COVID-19患者的生物样本，从血清和鼻拭子到尿液和DNA分离物，并使用这些样本创建一系列复杂的数据集。
校园内不同生物医学研究领域的专家在他们的实验室中创建了这些多维数据集，然后收集并组合在一起，通过一个名为the的公共在线门户网站共享COVIDome探险家．
从转录组(RNA数据集)到蛋白质组(蛋白质数据集)，从细胞因子(免疫功能标志物)到代谢组学(告知代谢)，研究人员可以快速访问这项工作，更有效地推进他们自己的假设。
来自意大利的博士后费德里卡·皮亚尼医学博士说:“他们帮了我们很多忙。”她和加州大学管理学院教授使用covid - 19探索者进行研究理查德·约翰逊医学博士，正在指挥。“他们按照我们的要求进行了分析，速度非常快。在一周内，我们已经得到了我们所要求的结果，”她说庞大的研究团队项目背后。
Piani和Johnson的肾脏疾病和高血压科正在研究结果较差的COVID-19患者的尿酸如何以及为什么更高。“我们发现了一些有趣的途径，”皮亚尼说。
新冠疫情促使各国快速应对
得益于大量研究志愿者的投入，以及埃斯皮诺萨和他的团队在世界卫生组织已经奠定的基础，COVIDome项目于11月启动，在五个月内上线琳达·克尼克唐氏综合症研究所．
“每个人都说是的，”埃斯皮诺萨谈到他来自校园各个学科的同事，他们热情地为这项工作做出了贡献。之后领导了五年类似的建设人类三体计划为了在Crnic研究所进行唐氏综合症研究，埃斯皮诺萨迅速将covid - ome项目整合在一起。
这一概念提供了迄今为止COVID-19研究中最深入的数据集之一，在发表之前就向公众开放了科学家的工作。埃斯皮诺萨说:“没有人有门户网站可以在发布之前访问如此数量和类型的数据。”“这是反。”
但是，尤其重要的是，在全球大流行期间，人们迫切需要发现，埃斯皮诺萨预测，开放科学概念的时代已经到来。
“我认为这就是未来，”皮亚尼说。她说:“你有很多数据，你可以分享想法。”她补充说，拥有covid - ome团队的多学科专业知识，可以减少她的背景工作，比如搜索过去的文章。“你可以问他们，他们知道。他们可以告诉你是否有人在做同样的话题。”
“这是发现的最快途径”
帮助整理门户数据的信息服务IT专业负责人凯尔·巴奇(Kyle Bartsch)说，由于在线门户是公开的，这意味着用户不需要登录，不可能100%可靠地提供不同用户的数据。
“在一天结束的时候，如果你的使命是一致的，这
是发现的最快途径。——Joaquin Espinosa博士
然而，分析显示，自COVIDome Explorer推出以来，至少有350名用户和590个独立会话。用户来自10个国家和美国各地。
鉴于他所看到的热情，埃斯皮诺萨说，他希望看到这个概念扩展到整个校园的研究领域，从癌症到心脏病学。
“这让人想知道，在COVID-19之后，我们还能以这种高度合作的方式做些什么?在没有大流行压力的情况下，我们还能通过开放科学原则解决什么问题?归根结底，如果你的任务是一致的，这是发现的最快途径。”
2023年1月20日