covid - ome在线门户网站可以迅速加速全球冠状病毒研究

为了进一步加快全球范围内的COVID-19研究，来自世界卫生组织的研究人员科罗拉多大学安舒茨医学院创建了一个多维数据集，称为COVIDome数据集，来自住院COVID-19患者与阴性对照。该团队现在已经推出了一个名为COVIDome探险家实时共享数据。

今天，一篇新论文发表在杂志上细胞的报道详细介绍了数据集是如何生成的，同时解释了如何使用COVIDome Explorer进行快速假设检验、假设生成和专家和非专家的实时发现。

“我们开发covid - ome Explorer的使命是为COVID-19的临床管理开发更好的预防、诊断和治疗工具，”该大学教授Joaquin Espinosa博士说科罗拉多大学医学院和执行董事琳达·克尼克唐氏综合症研究所在加州大学安舒茨医学院“尽管在所有这些领域都取得了巨大进展，但由于缺乏任何人都可以实时分析和重新分析的广泛可用的公共数据集，COVID-19的研究速度受到了阻碍。”

他补充说:“我们预计这个在线门户网站将迅速加快全球COVID-19数据共享、假设检验和发现。”

轻松、及时地获取COVID-19数据

为了创建COVIDome Explorer, CU安舒茨医学院不同生物医学研究领域的专家在他们的实验室中创建了多维数据集。这些信息被收集并组合在一起，通过在线门户网站分享。数据集包括人口统计学和临床数据，以及全血转录组的匹配分析，血浆和红细胞代谢组的分析，通过大规模细胞术和血清转换试验进行深度免疫表型分析。

covid - 19数据集和相应的Explorer是模仿琳达·克尼克唐氏综合症研究所正在进行的类似工作，该研究所的covid - 19团队成员此前开发了人类三体项目及其项目TrisomExplorer数据门户。利用TrisomExplorer的前沿工具和技术，该团队在几周内创建了COVIDome Explorer，并向公众提供，以帮助推进COVID-19研究。

共享COVID-19数据对于抗击疫情至关重要

科罗拉多大学安舒茨医学院研究副校长Thomas Flaig医学博士说:“COVID-19大流行造成的全球健康危机进一步强调了快速合作、开放获取审稿和数据共享的必要性。”“随着COVID-19 Delta变体的增加和突破性感染率的上升，现在比以往任何时候都更重要的是，方便及时地获取COVID数据，以对抗大流行，并提供现有的最佳科学数据。”

鼓励用户阅读的这篇论文详细介绍了如何使用在线仪表板以及指向指导用户的数据文件的链接，例如每个数据集中存在的蛋白质、代谢物、细胞因子和免疫细胞的目录。

例如，为了方便快速和广泛地访问covid - ome数据集，每个数据集(经过数据管理和质量控制)在样本级别上使用唯一标识符进行链接，从而实现平台之间的交叉引用。此外，COVIDome Explorer有六个仪表板:队列、转录组、蛋白质组、细胞因子、代谢组和免疫地图。每个仪表板都在自己的隔离和受保护的环境中运行。

COVIDome项目是哥伦比亚大学医学院和研究副校长办公室之间的合作项目，由Joaquin Espinosa博士和Thomas Flaig医学博士共同领导。欲了解更多信息，请访问www.covidome.org．