蛋白质折叠和功能-马勒拉博士实验室| CU药学院

项目1:肌营养不良蛋白和肌营养蛋白的结构-功能-疾病分析

肌肉萎缩症(MD)是指一组导致进行性肌肉无力的退行性肌肉疾病。MD会影响所有类型的肌肉。例如，心肌功能下降会导致心脏疾病，包括心肌病和充血性心力衰竭。杜氏MD (DMD)和贝克尔MD (BMD)是MD的两种主要类型，这是由一种称为肌营养不良蛋白的重要肌肉蛋白质缺乏引起的。这些与肌营养不良蛋白相关的疾病使患者身体虚弱，无法行动，经常导致过早死亡。肌营养不良蛋白稳定肌膜对抗机械力与肌肉收缩和拉伸。营养不良蛋白的突变会引发这种疾病。尽管30年前，营养不良蛋白被确定为MD的关键分子，但在基本蛋白质水平上引发该疾病的生物物理机制知之甚少。

在动物实验中，与营养不良蛋白(dystrophin)最接近的同源物(序列相似性为60%)已被证明可以补偿功能性营养不良蛋白的损失，但其确切的生物学功能尚不清楚。它与肌动蛋白结合，保护肌动蛋白不发生解聚，并与肌萎缩蛋白相关蛋白相互作用。在胎儿和再生肌细胞中，Utrophin仅局限于肌膜。出生时下调后，仅存在于成人肌肉细胞的神经肌肉连接处，以帮助突触的最佳传递，并在这些连接处发挥稳定作用。

在这个项目中，我们试图了解这两种重要蛋白质如何发挥作用的生物物理和结构原理，对致病突变的影响，以及我们是否可以在对营养不良蛋白和营养不良蛋白结构功能的基本理解的基础上开发新的治疗方法。

最近的出版物

S.M. Singh, S. Bandi, K.M.G. Mallela, n端侧区调节肌动蛋白的结合亲和力，生物化学，56(2017)2627-2636。PDF
S.M. Singh, S. Bandi, K.M.G. Mallela, N端和c端结构域对营养不良蛋白和营养不良蛋白串联钙钙蛋白同源结构域的差异贡献，生物化学，54(2015)6942-6950。PDF
S. Bandi, S.M. Singh，和K.M.G. Mallela，结构域间连接子主要决定营养不良蛋白和营养营养蛋白串联钙钙蛋白同源结构域的结构稳定性，而不是它们的肌动蛋白结合亲和力，生物化学，54(2015)5480-5488。PDF
S.M. Singh, S. Bandi, D.D. Shah, G. Armstrong和K.M.G. Mallela，抗肌萎缩蛋白中引发x连锁扩张型心肌病的错误意义突变Lys18Asn降低蛋白质稳定性，增加蛋白质展开，扰乱蛋白质结构，但不影响蛋白质功能，PLoS One, 9 (2014) e110439。PDF
S. Bandi, S.M. Singh和;K.M.G.Mallela, utrophin串联钙钙蛋白同源结构域的c端结构域在热力学和动力学上比全长蛋白更稳定，生物化学，53(2014)2209-2211。PDF

项目2:赋形剂与药物蛋白的相互作用机制

辅料在将原料药配制成药品的过程中起着重要作用。这些包括抗菌防腐剂，如苯甲醇，以防止蛋白质配方中微生物的意外生长，聚集抑制剂，如聚山梨酸酯，活性氧清除剂，如蛋氨酸，表面去吸附剂，如硅油，以及其他。原则上，赋形剂应该是惰性物质，仅作为药物或活性物质的载体或介质，但实际上，这些赋形剂可能与蛋白质药物相互作用，导致不必要的蛋白质不稳定和聚集。在这个项目中，我们试图了解辅料与药物蛋白相互作用的基本生物物理和结构机制，使用了一套生物物理技术，包括远紫外和近紫外圆二色，荧光，等温滴定量热法，差示扫描量热法和2D NMR。这项工作是作为我们的制药生物技术中心的一部分进行的，请与我们联系任何未来的合作。

最近的出版物

D. Shah, J. Zhang, H. Maity, K.M.G. Mallela，光降解对IgG1单克隆抗体结构、稳定性、聚集和功能的影响，国际药学杂志，547(2018)438-449。PDF
S.M. Singh, S. Bandi, D.N.M. Jones，和K.M.G. Mallela，聚山核桃酯20和聚山核桃酯80对单克隆抗体及其Fab和Fc片段高阶结构的影响，二维核磁共振波谱探测，药物科学杂志，106(2017)3486-3498。PDF
R.L. Bis, S.M. Singh, J. Cabello-Villegas，和K.M.G. Mallela，苯甲醇在干扰素α -2a的展开和聚集中的作用，药物科学杂志，104(2015)407-415。PDF
R.L. Bis和K.M.G. Mallela，抗菌防腐剂诱导干扰素α -2a聚集:防腐剂诱导蛋白质聚集的顺序与蛋白质无关，国际药学杂志，472(2014)356-361。PDF
R.L. Bis, T.M. Stauffer, S.M. Singh, T.B. Lavoie，和K.M.G. Mallela，高产量可溶性细菌表达和重组人干扰素α -2a的流线纯化，蛋白质表达和纯化，99(2014)138-146。PDF

张俊杰，张俊杰，马雷拉，光降解对IgG1单克隆抗体结构、稳定性、聚集和功能的影响，国际药剂学杂志， 547(2018) 438-449。摘要|全文|PDF
D. Shah, S.M. Singh, M. Dzieciatkowska, K.M.G Mallela, 4-oxononenal化学修饰对结合免疫球蛋白蛋白(BiP)结构、稳定性和功能影响的生物物理分析，《公共科学图书馆•综合》， 12 (2017) e0183975。摘要|全文|PDF
S.M. Singh, S. Bandi, D.N.M. Jones, K.M.G. Mallela，聚山梨酯20和聚山梨酯80对单克隆抗体高阶结构及其Fab和Fc片段的影响，用二维核磁共振波谱法探测，药学杂志， 106(2017) 3486-3498。摘要|全文|PDF
S. m . Singh, S. Bandi, K.M.G. Mallela, n端侧区调节肌动蛋白与肌营养素串联钙钙蛋白同源域的结合亲和力，生物化学， 56(2017) 2627-2636。摘要|全文|PDF
S.M.辛格，S.班迪，还有K.M.G. MallelaN端和c端结构域对营养不良蛋白和营养不良蛋白串联钙钙蛋白同源结构域的结构和功能有不同的贡献，生物化学， 54(2015) 6942-6950。摘要|全文|PDF
s·班迪，s·m·辛格，还有K.M.G. Mallela，结构域间连接子主要决定营养不良蛋白和营养不良蛋白串联钙钙蛋白同源结构域的结构稳定性，而不是它们的肌动蛋白结合亲和力，生物化学， 54(2015) 5480-5488。摘要|全文|PDF
r。l。比斯，S.M.。辛格，j。卡贝洛。维勒加斯，还有K.M.G. Mallela苯甲醇在干扰素α -2a展开和聚集中的作用药学杂志， 104(2015) 407-415。摘要|全文|PDF
S.M.辛格，s.b.班迪，D.D.沙阿，G.阿姆斯特朗，还有K.M.G. Malleladystrophin中引发x连锁扩张型心肌病的错义突变Lys18Asn降低了蛋白质稳定性，增加了蛋白质展开，扰乱了蛋白质结构，但不影响蛋白质功能，《公共科学图书馆•综合》， 9 (2014) e110439。摘要|全文|PDF．
R.L. Bis和K.M.G. Mallela抗菌防腐剂诱导干扰素α -2a聚集:防腐剂诱导蛋白质聚集的顺序与蛋白质无关，国际药剂学杂志， 472(2014) 356-361。摘要|全文|PDF
R.L.比斯，T.M.斯托弗，S.M.辛格，T.B.拉沃伊，还有K.M.G. Mallela重组人干扰素α -2a的高效可溶性细菌表达及流线型纯化;蛋白表达及纯化， 99(2014) 138-146。摘要|全文|PDF
s·班迪，s·m·辛格，还有K.M.G. Mallelac端结构域的钙钙蛋白同源结构域在热力学和动力学上比全长蛋白更稳定，生物化学， 53(2014) 2209-2211。摘要|全文|PDF
S.M.辛格，S.J.班迪，S.J.温德，还有K.M.G. Mallela，肌动蛋白与肌动蛋白结合的亲和性主要由其n端结构域决定，生物化学， 53(2014) 1801-1809。摘要|全文|PDF
r·l·哈钦斯，s·m·辛格，j·卡贝洛·维勒加斯，还有K.M.G. Mallela,抗菌防腐剂对部分蛋白质展开和聚集的影响药学杂志， 102(2013) 365-376。摘要|全文|PDF
S.M.辛格和K.M.G. Mallela，肌萎缩蛋白的n端肌动蛋白结合串联钙钙蛋白同源结构域(CH)在溶液中呈封闭构象，当与f -肌动蛋白结合时，生物物理期刊， 103(2012) 1970-1978。摘要|全文|PDF．获选最新最值得关注奖项:生物物理期刊， 103(2012) 1818-1819。全文|PDF
S.M.辛格，J.F. Molas, N. Kongari, S. Bandi, G.S. Armstrong, S.J. Winder和K.M.G. Mallela，肌营养蛋白和营养不良蛋白n端肌动蛋白结合域的热力学稳定性、展开动力学和聚集，蛋白质:结构、功能和生物信息学，80(2012)1377-1392。摘要|全文|PDF
S.M.辛格，R.L.哈钦斯，还有K.M.G. Mallela，机制米使用模型蛋白细胞色素研究-甲酚诱导的蛋白质聚集c，药学杂志， 100(2011) 1679-1689。摘要|全文|PDF
S.M.辛格，N. Kongari, J. Cabello-Villegas，和K.M.G. Mallela引起肌肉萎缩症的肌萎缩蛋白突变会降低蛋白质稳定性，并导致交叉-聚集，美国国家科学院院刊，107(2010) 15069-15074。摘要|全文|PDF
s.m·辛格，j·卡贝洛·维勒加斯，r·l·哈钦斯，还有K.M.G. Mallela部分蛋白质展开在酒精诱导蛋白质聚集中的作用蛋白质:结构、功能和生物信息学， 78(2010) 2625-2637。摘要|全文|PDF
K.M.G. Mallela制药生物技术-概念与应用，人类基因组学， 4(2010) 218-219。全文|PDF
美国Bedard说^__，M.M.G.克利须那神^__， L. Mayne和S.W. Englander，《蛋白质折叠:独立的不相关通路或具有可选误差的预定通路》，美国国家科学院院刊， 105(2008) 7182-7187。（^__平等的贡献)摘要|全文|PDF
S.W.英格兰德，L.梅恩，还有M.M.G.克利须那神,蛋白质折叠和错误折叠:机理和原理，《生物物理学季刊》， 40(2007) 287-326。摘要|全文|PDF
M.M.G.克利须那神， H. Maity, J.N. Rumbley，和S.W. Englander，细胞色素连续折叠途径的分支c，蛋白质科学， 16(2007) 1946-1956。摘要|全文|PDF
M.M.G.克利须那神和S.W.英格兰德，统一的蛋白质折叠机制:带有可选误差的预定路径，蛋白质科学， 16(2007) 449-464。摘要|全文|PDF
M.M.G.克利须那神， H. Maity, J.N. Rumbley, Y. Lin和S.W. Englander，细胞色素的步骤顺序c折叠途径:序列稳定机制的证据，分子生物学杂志，359(2006) 1410-1419。摘要|杂志封面|全文|PDF
R. Pidikiti, T. Zhang，K.M.G. Mallela， M. Shamim, K.S. Reddy和J.S. Johansson，七氟醚诱导的四螺旋束蛋白结构变化，生物化学， 44(2005) 12128-12135。摘要|PDF
R. Pidikiti, T. Zhang，K.M.G. Mallela， M. Shamim, K.S. Reddy和J.S. Johansson，七氟醚结合后四螺旋束蛋白的结构变化，国际会议系列， 1283(2005) 155-159。摘要|全文|PDF
R. Pidikiti, M. Shamim，K.M.G. Mallela,K.S. Reddy和J.S. Johansson，结合挥发性全麻氟烷的四螺旋束蛋白的表达和特性，《生物高分子， 6(2005) 1516-1523。摘要|全文|PDF
H. Maity, M. Maity，M.M.G.克利须那神， L. Mayne, S.W. Englander，《蛋白质折叠:折叠单元的阶梯式组装》，美国国家科学院院刊， 102(2005) 4741-4746。摘要|全文|PDF
M.M.G.克利须那神和S.W. Englander，蛋白质折叠和功能的n端到c端基序，美国国家科学院院刊， 102(2005) 1053-1058。摘要|PDF
M.M.G.克利须那神， Y. Lin, S.W. Englander，蛋白质错误折叠:可选的障碍，错误折叠的中间产物和途径异质性，分子生物学杂志， 343(2004) 1095-1109。摘要|全文|PDF
M.M.G.克利须那神,L. Hoang, Y. Lin, S.W. Englander，研究蛋白质折叠的氢交换方法，方法， 34(2004) 51-64。摘要|全文|PDF
M.M.G.克利须那神， Y. Lin, L. Mayne，和S.W. Englander，动态蛋白质折叠中间体的亲密关系:残基分解结构，相互作用，稳定性，折叠和展开速率，同质性，分子生物学杂志， 334(2003) 501-513。摘要|全文|PDF
L.黄，H. Maity，M.M.G.克利须那神，林旸，S.W.英格兰德，细胞色素c碱性转变的折叠单元，分子生物学杂志， 331(2003) 37-43。摘要|全文|PDF
M.M.G.克利须那神林毅夫，林毅夫，林毅夫，欧米茄环在细胞色素c折叠和功能中的作用，分子生物学杂志， 331(2003) 29-36。摘要|全文|PDF
黄良，Bédard，M.M.G.克利须那神林毅夫，林毅夫，杨志伟，细胞色素c折叠途径:原生态氢交换动力学，美国国家科学院院刊， 99(2002) 12173-12178。摘要|全文|PDF
修正:美国国家科学院院刊， 99(2002) 15831。全文|PDF
M.M.G.克利须那神，研究蛋白质如何折叠，炼金术士(化学学报)，2002。PDF
S.W.英格兰德和M.M.G.克利须那神，氢交换，自然结构生物学， 8(2001) 741-742。全文|PDF
A.S.R.科技,M.M.G.克利须那神,和N. Periasamy，时间分辨区域标准化发射光谱(TRANES):一种确认两种激发态发射的新方法，物理化学杂志A105(2001) 1767-1771。摘要|全文|PDF
M.M.G.克利须那神， A. Srivastava, N. Periasamy，表面探针在脂质囊泡中的旋转动力学，生物物理化学， 90(2001) 123-133。摘要|全文|PDF
错误:生物物理化学， 91 (2001)全文|PDF
A. Mishra, G.B. Behera，M.M.G.克利须那神,氨基苯基吡啶染料在有机溶剂和表面活性剂胶束中的时间分辨荧光研究发光学报， 92(2001) 175-188。摘要|全文|PDF
M.M.G.克利须那神， J. Samuel和S. Sinha，球体上的布朗运动:立体角的分布，物理杂志A:数学与一般， 33(2000) 5965-5971。摘要|全文|PDF
ArXiv上还有:http://arxiv.org/abs/cond-mat/0005345v3|PDF
M.M.G.克利须那神， R. Das, N. Periasamy, R. Nityananda，荧光探针在球体上的平移扩散:蒙特卡罗模拟，理论和荧光各向异性实验，化学物理杂志， 112(2000) 8502-8514。摘要|全文|PDF
M.M.G.克利须那神，生物系统中的荧光探针动力学，博士论文，孟买大学塔塔基础研究所，印度，1999。PDF©M.M.G. Krishna & N. Periasamy。提及未发表的成果时，请引用论文。
M.M.G.克利须那神脂质双分子膜中DODCI的位置和取向:脂链长度和不饱和的影响，生物化学与生物物理学报(生物膜)， 1461(1999) 58-68。摘要|全文|PDF
M.M.G.克利须那神、疏水探针尼罗红在膜和胶束中的激发态动力学;物理化学杂志A， 103(1999) 3589-3595。摘要|全文|PDF
补充和更正:物理化学杂志A， 103(1999) 4129。全文|PDF
更多的修正:PDF
M.M.G.克利须那神N. Periasamy，线性染料分子在双分子层膜中的定向分布，化学物理通讯， 298(1998) 359-367。摘要|全文|PDF
M.M.G.克利须那神， V.K. Rastogi, N. Periasamy，和K.V.R. Chary，人类精浆前列腺抑制素的荧光和核磁共振研究:生命与空间约束色氨酸的关系，物理化学杂志B， 102(1998) 5520-5528。摘要|全文|PDF
M.M.G.克利须那神和N. Periasamy，有机染料在脂膜中的荧光:增溶部位和粘度和折射率对寿命的影响，荧光学报， 8(1998) 81-91。摘要|全文|PDF
北卡罗来纳州Maiti,M.M.G.克利须那神， P.J. Britto, N. Periasamy，胶束中染料探针的荧光动力学，物理化学杂志B， 101(1997) 11051-11060。摘要|全文|PDF
M.M.G.克利须那神和N. Periasamy，生物膜系统中荧光衰变的光谱约束全局分析，分析生物化学， 253(1997) 1-7。摘要|全文|PDF

如有意见、建议或投诉，请电邮Krishna.Mallela@CUAnschutz.edu．

本页提供的PDF文件仅用于科学研究，非商业研究。至于其他用途，用户应与相关版权持有人联系。


Dinen Shah:研究生电话:303-724-3577 电子邮件:Dinen.Shah@ucdenver.edu Dinen目前的研究是确定脂质过氧化产物对热休克蛋白、78 kDa葡萄糖调节蛋白(GRP78)的结构和功能的影响，以及氧化和单克隆抗体等化学修饰的影响。
斯科特·帕迪:研究生电话:303-724-3577 电子邮件:Scott.Pardee@CUAnschutz.edu 斯科特目前的研究方向是赋形剂与药物蛋白的相互作用。
Swati Bandi博士:博士后电话:303-724-3577 电子邮件:Swati.Bandi@CUAnschutz.edu Swati目前的研究是描述营养不良蛋白和营养不良蛋白的串联钙钙蛋白同源结构域的结构动力学，以及聚山核桃酯与单克隆抗体的相互作用。
Vaibhav Upadhyay博士:博士后电话:303-724-3577 电子邮件:Vaibhav.Upadhyay@CUAnschutz.edu Vaibhav目前的研究方向是营养不良蛋白和营养不良蛋白的结构功能特征。


Regina L. Bis博士:博士后研究员电话:303-724-3577 电子邮件:Regina.Bis@ucdenver.edu Regina目前的研究是确定酒精和抗菌剂-防腐剂诱导的模型蛋白细胞色素c和药物蛋白干扰素α -2a聚集的机制。
贾斯汀·f·莫拉斯:研究生 Justine优化了dystrophin和utrophin的表达和纯化方案，并对这些蛋白进行了初步的生物物理表征。
达林·布朗:研究生 Darin研究死亡结构域Fas、FADD、DR4和DR5的表达和纯化，这些结构域与凋亡信号通路有关。
约瑟夫·罗厄:研究生 Joseph研究了Hofmeister系列对细胞色素c热聚集的影响。
Surinder M. Singh博士:博士后研究员电话:303-724-3577 电子邮件:Surinder.Singh@ucdenver.edu 苏林德目前的研究是关于肌营养不良蛋白和营养不良蛋白的生物物理学特征，这是涉及肌肉营养不良的两种关键蛋白质。