大卫·本特利博士

我们的研究问如何RNA聚合酶II转录机械和RNA加工因素共同实现协调的合成和成熟的信使核糖核酸(mRNA)。耦合mRNA转录和处理的准确、有效地对所有细胞的健康至关重要,在许多疾病损坏。做一个功能齐全的mRNA需要合成的主要转录的RNA聚合酶II和成熟成绩单通过限定5”,去除内含子的剪接和添加多聚腺苷酸尾3 '端。成熟的信使rna是“礼物”结合蛋白,直接出口核胞浆。夫妻合成的分子机制的中心件加工和出口mRNA的c端域或仪,一个签名功能最大的RNA聚合酶II的亚基。如果这个域删除,记录失去身份信使rna前体。很多的项目在我们的实验室测试在一个信使rna工厂一起,包括RNA聚合酶II mRNA加工因素结合,供“停机坪”。

因为信使rna合成深刻misregulated癌症细胞,我们正在调查转录和pre-mRNA处理的集成在正常和转化细胞。我们使用的策略来解决这个问题包括酵母和人类细胞的遗传操作,蛋白质相互作用,染色质免疫沉淀反应和全基因组转录和mRNA加工定位蛋白质ChIP-Chip和ChIP-Seq下一代测序方法。

图:Pre-mRNA处理因素和伸长因素与人类RNA聚合酶II (pol II)转录延伸复杂

守恒的七个重复序列的)。波尔II c端域(CTD)是动态磷酸化和脱去磷酸丝氨酸2、5和7在转录周期。人类限制酶(HCE),帽甲基转移酶(MT),乳沟聚腺苷酸化因素,CPSF, CstF Spt5和Spt6伸长的因素。我们如何工作的磷酸化转录的RNA聚合酶II CTD控制耦合伸长和终止pre-mRNA co-transcriptional处理。

B)。5 ' 3 ' RNA聚合酶II的分布密度对一个典型的人类基因显示暂停在网站和下游的聚(a)的网站。我们如何转录暂停工作,延长汽车在癌细胞。

目前我们实验室的研究项目

1. co-transcriptional信使rna如何处理肿瘤细胞与正常细胞有何不同?
2. 转录的速度如何影响co-transcriptional mRNA加工吗?
3. pre-mRNA如何处理由磷酸化的RNA聚合酶II c端域?
4. 染色质结构和组蛋白修饰如何影响co-transcriptional pre-mRNA处理?
5. 如何磷酸化的RNA聚合酶II c端域影响转录延伸和终止?
6. 特定的染色质结构基因是如何控制的目标组蛋白脱甲基作用吗?
7. pre-mRNA如何处理因素本地化的全基因组在正常和乳腺癌细胞?

旋转的学生是受欢迎的。