Srinivas Ramachandran博士

活体核小体结构与动力学

我们的基因组通过被称为核小体的蛋白质- dna复合物的形成被包装在细胞核中。核小体调节进入基因组的途径，必须不断被破坏和改造，以形成可进入的DNA格局。核小体的形成是由于组蛋白八聚体(蛋白质成分)和147 bp的DNA之间的多次强接触。我们的实验室试图了解这些接触在细胞内转录和复制等关键过程中是如何断裂和重建的。我们开发了具有基因组读数的生化方法，以高空间和时间分辨率推断细胞内核小体的结构状态。我们使用这些方法来了解DNA结合蛋白和染色质重塑器如何修改核小体结构来调节DNA可及性。

我们感兴趣的核小体格局的另一个方面是染色质状态是如何被记住的:许多染色质状态通过复制过程中的稀释和转录过程中的破坏而持续存在。这种细胞记忆是如何维持的?通过开发追踪染色质状态的实验方法，我们的目标是揭示通过连续的细胞分裂维持染色质状态的细胞记忆的基本机制。